Penyebab utama penyakit migren tidak diketahui meski demikian, penyakit tersebut diyakini berhubungan dengan gabungan faktor lingkungan dan genetik. Penyakit ini terjadi pada orang yang sudah berkeluarga sebanyak dua-pertiga dari seluruh kasus yang terjadi dan jarang terjadi akibat cacat gen tunggal. Sejumlah kondisi psikologis yang memiliki keterkaitan antara lain : Depresi, kecemasan, dan gangguan bipolar sebagaimana berbagai kejadian biologis atau pemicu.
Penyebab terjadinya migren bisa disebabkan oleh beberapa faktor, seperti :
- Faktor Genetik,
- Faktor Pemicu,
- Aspek Fisioogis,
- Aspek Makanan,
- Aspek Lingkungan,
Disimpulkan bahwa semua bukti yang ada untuk mendukung pemicu potensial pada lingkungan di dalam maupun di luar kualitasnya kurang, namun tetap disarankan pada para penderita migren untuk mengambil langkah pencegahan terkait kualitas udara dan pencahayaan dalam ruang. Pernah diyakini bahwa migren lebih banyak terjadi pada orang-orang berinteligensi tinggi, namun hal ini tidaklah benar.